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1990年以来高校合并情况
（截止到2006年5月15日）
| 序号 | 合并后学校名称 | 主管部门 | 参与合并学校名称 | 合并时间 |
| 30 | 南平师范专科学校 | 福建省 | 南平师范专科学校 南平职业大学 | 1991-2-25 |
| 31 | 宁德师范专科学校 | 福建省 | 宁德师范专科学校 闽东职业大学 | 1991-2-25 |
| 90 | 集美大学 | 福建省 | 集美航海学院（保留建制） 厦门水产学院 福建体育学院 集美财经高等专科学校 集美师范专科学校 |
1994-10-8 |
| 275 | 福建农林大学 | 福建省 | 福建农业大学 福建林学院 | 2000-6-5 |
| 279 | 三明高等专科学校 | 福建省 | 三明师范高等专科学校 三明职业大学 三明市教师进修学校 三明师范学校 | 2000-6-12 |
| 352 | 闽江学院 | 福建省 | 福州师范高等专科学校 闽江职业大学 | 2002-3-21 |
| 353 | 莆田学院 | 福建省 | 莆田高等专科学校 福建医大莆田分校(专科) 莆田华侨体育师范学校 |
2002-3-21 |
| 360 | 福建工程学院 | 福建省 | 福建建筑高等专科学校 福建职业技术学院 | 2002-3-21 |
| 370 | 漳州职业技术学院 | 福建省 | 漳州职业大学 漳州农业机械学校 | 2002-6-6 |
| 406 | 闵西职业技术学院 | 福建省 | 闵西职业大学 龙岩市工业学校 | 2004-3-2 |